Glosario de investigación sobre péptidos
Una referencia exhaustiva de la A a la Z sobre la terminología de los péptidos y los compuestos de investigación. Abarca la síntesis, los ensayos, la farmacología y la práctica de laboratorio.
A
7 términosADME
Absorción, distribución, metabolismo y excreción. Los cuatro parámetros farmacocinéticos estudiados en in vivo son modelos de investigación que permiten caracterizar el comportamiento de los compuestos en los sistemas biológicos. El perfil ADME es un componente estándar de la investigación farmacocinética preclínica y abarca todo el ciclo de vida de un compuesto, desde su absorción inicial hasta su eliminación.
Agonista
Compuesto que se une a un receptor y lo activa, iniciando una cascada de señalización posterior. En la investigación sobre péptidos, los agonistas se utilizan para estudiar la función de los receptores y caracterizar las vías de señalización intracelulares. Los agonistas completos producen la máxima activación del receptor, mientras que los agonistas parciales provocan respuestas submáximas cuando el receptor está completamente ocupado. El grado de actividad del agonista se cuantifica habitualmente mediante los valores de «EC50» en ensayos de respuesta a la dosis.
Aminoácido
La unidad monomérica fundamental a partir de la cual se construyen los péptidos y las proteínas. Cada aminoácido está formado por un átomo de carbono central unido a un grupo amino, un grupo carboxilo, un átomo de hidrógeno y una cadena lateral variable (grupo R) que determina sus propiedades químicas. El código genético codifica veinte aL-amino acides estándar, aunque en los péptidos de investigación se incorporan con frecuencia residuos no estándar, como los aes D y los análogos sintéticos, con el fin de modificar la actividad biológica o la estabilidad metabólica.
Analógico
Compuesto sintético relacionado estructuralmente con una molécula natural, pero que incorpora modificaciones deliberadas en una o varias de sus características químicas. En la investigación sobre péptidos, los análogos se diseñan mediante sustituciones de aminoácidos, modificaciones en los extremos, alteraciones de la cadena principal o estrategias de conjugación, con el fin de investigar las relaciones estructura-actividad. Los análogos constituyen herramientas esenciales para estudiar cómo influyen determinados cambios estructurales en la unión a los receptores, la señalización y los parámetros farmacocinéticos.
Antagonista
Compuesto que se une a un receptor sin activarlo y bloquea la unión de agonistas endógenos o exógenos. Los antagonistas se utilizan en la investigación preclínica para caracterizar la función de los receptores mediante la observación de las consecuencias de la inhibición de las vías de señalización. Los antagonistas competitivos se unen de forma reversible al sitio ortostérico, mientras que los antagonistas no competitivos se unen a sitios alostéricos o de forma irreversible para bloquear la activación del receptor, independientemente de la concentración del agonista.
Agua bacteriostática
Agua estéril que contiene un 0,9 % de alcohol bencílico como conservante bacteriostático. Uno de varios solventes utilizados en laboratorio para la reconstitución de compuestos liofilizados; otras opciones habituales incluyen agua estéril para inyección, solución salina tamponada con fosfato (PBS) y ácido acético diluido, cuya elección depende de la solubilidad del compuesto y los requisitos del ensayo. El alcohol bencílico inhibe el crecimiento microbiano tras la perforación inicial del vial, lo que permite el uso repetido de un mismo envase. Destinada exclusivamente a su uso en entornos de investigación in vitro.
Afinidad de unión
Una medida cuantitativa de la intensidad de la interacción entre un ligando y su receptor diana, que suele expresarse como una constante de disociación (Kd). Los valores más bajos de Kd indican una unión más fuerte. La afinidad de unión se determina mediante ensayos de in vitro, tales como el desplazamiento de radioligandos, la resonancia plasmónica superficial o la calorimetría de titulación isotérmica. Se trata de un parámetro fundamental en la investigación sobre farmacología de receptores y una variable clave en los estudios de relación estructura-actividad.
B
2 términosBiodisponibilidad
La fracción de un compuesto administrado que llega a la circulación sistémica sin haber sido metabolizada. La biodisponibilidad es un parámetro farmacocinético clave que se caracteriza en los modelos de investigación preclínicos de in vivo y que se ve influida por la vía de absorción, el metabolismo de primer paso, la degradación enzimática y la formulación. Los compuestos peptídicos suelen plantear dificultades en cuanto a la biodisponibilidad debido a su susceptibilidad a la degradación proteolítica, lo que ha impulsado la investigación sobre modificaciones estructurales, tales como la sustitución de aminoácidos D, la «PEGylation» y la modificación de los extremos.
Blood-Brain Barrier (BBB)
La membrana semipermeable selectiva que separa la sangre circulante del líquido extracelular del sistema nervioso central. Formada por uniones estrechas entre las células endoteliales cerebrales, la barrera hematoencefálica (BBB) restringe el paso de la mayoría de las moléculas circulantes al SNC. La penetración de la barrera hematoencefálica es una variable farmacocinética clave que se estudia en la investigación preclínica con péptidos, y las estrategias para facilitar el acceso al SNC —entre las que se incluyen la lipidación, la conjugación con péptidos penetrantes en las células y la transcitosis mediada por receptores— constituyen áreas de investigación muy activas.
C
3 términosCAS Número
Número de registro del Chemical Abstracts Service. Identificador numérico único asignado a cada sustancia química descrita en la literatura científica disponible. Los números del CAS proporcionan una referencia inequívoca para la identificación de compuestos, independiente de las convenciones de nomenclatura o los sinónimos. En la investigación sobre péptidos, los números del CAS se utilizan para confirmar la identidad de los compuestos entre distintos proveedores, publicaciones y documentación reglamentaria.
Certificate of Analysis
Documento de garantía de calidad emitido para un lote de producción específico de un compuesto de investigación. Un certificado de análisis (Certificate of Analysis, COA) suele incluir la confirmación de la identidad del compuesto, el porcentaje de pureza, el método analítico (como la cromatografía de gases-espectrometría de masas [HPLC] o la espectrometría de masas), el número de lote y cualquier dato relevante sobre impurezas. Los certificados de análisis proporcionan la documentación necesaria para llevar a cabo un trabajo experimental reproducible y están disponibles previa solicitud para todos los compuestos.
Condiciones de almacenamiento de productos liofilizados
Parámetros de almacenamiento recomendados para compuestos peptídicos liofilizados en entornos de investigación. Los péptidos liofilizados se suelen almacenar a -20 °C, protegidos de la luz y la humedad, para mantener su integridad química y pureza a lo largo del tiempo. Siempre que sea posible, se debe incluir desecante en los recipientes de almacenamiento. La reconstitución debe realizarse inmediatamente antes de su uso en los protocolos experimentales, y las soluciones reconstituidas deben almacenarse de acuerdo con los datos de estabilidad específicos de cada compuesto.
D
3 términosD-Amino Acid
Una forma estereoisomérica especular de la configuración estándar L-L-amino acid. La incorporación de aminoácidos D en los péptidos sintéticos confiere resistencia a la degradación proteolítica por parte de las enzimas endógenas, que reconocen preferentemente los sustratos con configuración L. La sustitución por aminoácidos D es una estrategia de modificación estructural ampliamente utilizada en la investigación preclínica con péptidos. Un ejemplo es el residuo D-Ala en la posición 2 de la dermorfina, del que se ha observado que contribuye a la estabilidad enzimática del compuesto y a su perfil de selectividad de receptores.
Dose-Response Relationship
La relación cuantitativa entre la concentración de un compuesto administrado en un modelo de investigación y la magnitud de la respuesta biológica observada. Las curvas dosis-respuesta son fundamentales para la investigación en farmacología de la respuesta dependiente de la dosis (in vitro) y la respuesta independiente de la dosis (in vivo), y se utilizan para determinar parámetros como la dosis media eficaz (EC50), la respuesta máxima (Emax) y el coeficiente de Hill. Estas relaciones son esenciales para comparar la potencia de los compuestos y caracterizar la farmacología de los receptores.
Degradación enzimática
La degradación de un péptido por las enzimas proteolíticas presentes en los sistemas biológicos. La degradación enzimática constituye uno de los principales retos farmacocinéticos que se investigan en el ámbito de la investigación sobre péptidos, ya que la mayoría de los péptidos lineales son rápidamente escindidos por endopeptidasas, aminopeptidasas y carboxipeptidasas en el suero y en los homogeneizados de tejidos. Esta degradación influye directamente en las estrategias de modificación estructural, tales como la sustitución de aminoácidos D, la modificación de los extremos, la ciclación y la «PEGylation», todas ellas diseñadas para prolongar la estabilidad de los compuestos en modelos de investigación preclínica.
E
5 términosEnlace disulfuro
Enlace covalente que se forma entre los átomos de azufre de dos residuos de cisteína dentro de un péptido o una proteína. Los enlaces disulfuro estabilizan la estructura tridimensional y son fundamentales para la actividad biológica de muchos péptidos de investigación, entre ellos la oxitocina (enlace intramolecular Cys1-Cys6) y los factores de crecimiento similares a la insulina (enlaces intermoleculares). La formación y la reducción de los enlaces disulfuro se estudian in vitro para comprender el plegamiento, la estabilidad y las relaciones entre estructura y función.
EC50
La concentración efectiva de mitad de máximo. La concentración de un compuesto que produce el 50 % de la respuesta máxima observada en un sistema de ensayo definido. EC50 es una medida estándar de la potencia de un compuesto en la investigación farmacológica in vitro y se determina a partir del análisis de la curva dosis-respuesta. Los valores más bajos de EC50 indican una mayor potencia. EC50 Los valores dependen del ensayo y deben interpretarse dentro del contexto experimental específico en el que se midieron.
Endógeno
Que tiene su origen en un sistema biológico. En la investigación sobre péptidos, el término «endógeno» se refiere a los compuestos que el organismo objeto de estudio produce de forma natural, como la hormona liberadora de la hormona del crecimiento, la oxitocina o el factor de crecimiento insulínico tipo 1. Los péptidos endógenos sirven como compuestos de referencia con los que se comparan los análogos sintéticos en los estudios sobre la relación estructura-actividad y la farmacología de los receptores.
Exógeno
Que tiene su origen fuera de un sistema biológico. En la investigación sobre péptidos, el término «exógeno» se refiere a los compuestos producidos sintéticamente y administrados a un modelo de investigación, a diferencia de los péptidos endógenos presentes de forma natural en el sistema. La administración exógena de péptidos sintéticos o análogos es un enfoque habitual en farmacología preclínica para investigar la función de los receptores y las vías de señalización posteriores.
Enlace peptídico
El enlace amida covalente que se forma entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo amino del siguiente mediante una reacción de condensación que libera agua. Los enlaces peptídicos constituyen la cadena principal de todas las estructuras peptídicas y proteicas. Este enlace presenta un carácter parcial de doble enlace, lo que restringe la rotación y confiere planicidad al enlace amida. Los enlaces peptídicos son los principales objetivos de las enzimas proteolíticas en los sistemas biológicos.
F
2 términosFórmula molecular
Notación que describe el número exacto y el tipo de átomos presentes en una sola molécula de un compuesto. En el caso de los péptidos, la fórmula molecular refleja la composición de aminoácidos tras la formación del enlace peptídico y cualquier modificación posterior a la síntesis. Las fórmulas moleculares se utilizan, junto con el peso molecular y el número de la «CAS», como identificadores estándar para la caracterización de compuestos en la documentación científica.
Farmacocinética
El estudio del comportamiento de un compuesto en un sistema biológico, que abarca la absorción, la distribución, el metabolismo y la excreción (ADME). Los parámetros farmacocinéticos —entre los que se incluyen la biodisponibilidad, la vida media, el volumen de distribución y el aclaramiento— se caracterizan en modelos de investigación preclínica in vivo. En el caso de los compuestos peptídicos, la investigación farmacocinética se centra especialmente en la estabilidad proteolítica, las vías de absorción y las estrategias para prolongar la exposición sistémica.
G
1 términosGHRH
Hormona liberadora de la hormona del crecimiento. Neuropéptido hipotalámico de 44 aminoácidos que actúa sobre el receptor de la hormona liberadora de la hormona del crecimiento (receptor de la GHRHa, R) en las células somatotróficas de la hipófisis anterior. La GHRHa es el ligando endógeno del receptor de la GHRHa, un receptor acoplado a proteínas G de clase B que transmite la señal a través de la adenilato ciclasa acoplada a la Gsa y la acumulación de cAMPa. Se han desarrollado análogos sintéticos del factor de crecimiento de la hipófisis (GHRH), como la sermorelina (GRF 1-29), el CJC-1295 y la tesamorelina, como herramientas de investigación que incorporan modificaciones estructurales estudiadas por su influencia en la unión al receptor y la estabilidad metabólica.
H
2 términosHPLC
Cromatografía líquida de alta resolución. Técnica analítica utilizada para separar, identificar y cuantificar los componentes individuales de una mezcla. En la investigación sobre péptidos, la cromatografía de alta resolución (HPLC) es un método estándar para evaluar la pureza de los compuestos mediante la separación del péptido objetivo de los subproductos de la síntesis, las secuencias truncadas y otras impurezas. La cromatografía de alta resolución en fase inversa (HPLC; RP-HPLC) es el modo más habitual utilizado para el análisis de péptidos. Los datos de la cromatografía de alta resolución (HPLC) constituyen un componente fundamental de los certificados de análisis.
Hidrólisis del enlace peptídico
La ruptura de un enlace peptídico por acción del agua, normalmente catalizada por enzimas proteolíticas (proteasas y peptidasas) en los sistemas biológicos. La hidrólisis del enlace peptídico es el mecanismo principal de degradación de los péptidos y un proceso fundamental que se estudia en la investigación farmacocinética preclínica. Comprender los sitios y las velocidades de hidrólisis en matrices biológicas proporciona información directa para las estrategias de modificación estructural —incluida la sustitución de aminoácidos D, la metilación de la cadena principal y la ciclación— diseñadas para conferir resistencia proteolítica.
I
4 términosIGF-1
Factor de crecimiento similar a la insulina tipo 1. Polipéptido de 70 aminoácidos que transmite su señal a través del receptor IGF-1 (IGF-1R), una tirosina quinasa receptora que activa las cascadas de señalización de la proteína PI3K/Akt y de la proteína MAPK/ERK. La actividad del IGF-1 en los sistemas biológicos está modulada por una familia de seis proteínas de unión al IGF (IGFBP-1 a IGFBP-6) que capturan el ligando y regulan su biodisponibilidad. Se han desarrollado análogos estructurales, como el IGF-1 LR3 y el Des(1-3)IGF-1, como herramientas de investigación con perfiles de unión al IGFBP modificados para facilitar el estudio de la señalización a nivel del receptor.
In vitro
Término latino que significa «en el tubo de ensayo». Se refiere a los experimentos realizados fuera de un organismo vivo, normalmente en cultivos celulares, preparaciones de tejidos, sistemas de órganos aislados o sistemas de ensayo bioquímico. Los estudios in vitro constituyen un componente fundamental de la investigación preclínica sobre péptidos, ya que permiten investigar de forma controlada la unión a los receptores, la señalización intracelular y la estabilidad de los compuestos en condiciones definidas.
In vivo
Término latino que significa «en el ser vivo». Se refiere a los experimentos realizados en un organismo vivo, normalmente roedores u otros modelos animales de investigación. Los estudios preclínicos in vivo investigan los parámetros farmacocinéticos, la biodistribución, la estabilidad de los compuestos y la participación de las vías sistémicas en condiciones fisiológicas que no pueden reproducirse en sistemas basados en células. Los datos in vivo complementan los resultados de los estudios in vitro y proporcionan un contexto para el comportamiento de los compuestos en entornos biológicos complejos.
Intramuscular (IM)
Una vía de administración del compuesto en el tejido muscular esquelético, estudiada como variable de investigación farmacocinética en modelos preclínicos in vivo. Se investiga la administración intramuscular para determinar su influencia en la cinética de absorción, la formación de depósitos y la biodisponibilidad en comparación con otras vías de administración. La velocidad de absorción desde un depósito intramuscular depende del flujo sanguíneo local, del peso molecular del compuesto y de las características de la formulación. La farmacocinética IM se caracteriza en roedores y otros modelos de investigación preclínica.
K
1 términosKd
Constante de disociación. Medida cuantitativa del equilibrio entre los estados de unión y de no unión de un complejo ligando-receptor. Kd se expresa en unidades de concentración molar y representa la concentración del ligando a la que el 50 % de los sitios de unión disponibles del receptor se encuentran ocupados en equilibrio. Los valores más bajos de Kd indican una mayor afinidad de unión. Kd se determina mediante ensayos de unión in vitro, tales como la unión por saturación, la unión por competencia o la resonancia plasmónica superficial.
L
3 términosLigando
Cualquier molécula que se une a un sitio específico de un receptor o una proteína diana. En la investigación sobre péptidos, los ligandos incluyen péptidos endógenos, agonistas sintéticos, antagonistas y moduladores alostéricos. El término abarca cualquier compuesto que establezca una interacción definida con una diana biológica, independientemente de si dicha interacción produce la activación del receptor. Las interacciones ligando-receptor se caracterizan por la afinidad de unión (Kd) y la potencia funcional (EC50).
Liofilización
También conocida como liofilización. Se trata de un proceso de deshidratación utilizado para conservar compuestos peptídicos de investigación mediante la eliminación del agua al vacío a baja temperatura. La liofilización convierte una solución peptídica en un polvo seco (polvo liofilizado) que mantiene su estabilidad química durante el almacenamiento y el transporte. El pastel o polvo liofilizado resultante se reconstituye con un disolvente adecuado antes de su uso en protocolos experimentales. La liofilización es el método de conservación estándar para los compuestos peptídicos sintéticos de investigación.
Liberación pulsátil
Un patrón de secreción intermitente y episódica observado en modelos de investigación preclínica para determinadas hormonas y neuropéptidos endógenos. La hormona del crecimiento, por ejemplo, se libera desde las células somatotróficas de la hipófisis en pulsos discretos, en lugar de de forma continua. La cinética de liberación pulsátil constituye una variable de investigación significativa en la farmacología de los secretagogos, ya que se ha observado que el patrón temporal de activación de los receptores influye en las respuestas de señalización posteriores de manera diferente a la activación sostenida. Los diseños de los estudios preclínicos suelen incorporar protocolos de dosificación pulsátil para modelar los patrones de secreción fisiológica.
M
2 términosMass Spectrometry
Técnica analítica que mide la relación masa-carga de los iones para determinar el peso molecular y la identidad estructural de un compuesto. En la investigación sobre péptidos, la espectrometría de masas (MS) se utiliza junto con el análisis cromatográfico (HPLC) para confirmar la identidad de los compuestos, detectar impurezas y verificar la exactitud de la secuencia. Entre los métodos de ionización habituales para el análisis de péptidos se incluyen la ionización por electrospray (ESI) y la ionización por desorción láser asistida por matriz (MALDI). Los datos de MS forman parte del conjunto de datos analíticos que se incluyen en los certificados de análisis.
Modificación de Terminus
Modificación química aplicada al extremo N-terminal (N-terminus) o al extremo C-terminal (C-terminus) de un péptido sintético. Entre las modificaciones habituales del extremo N-terminal se incluyen la acetilación y la lipoidación (como la palmitoilación). Entre las modificaciones habituales del extremo C-terminal se incluye la amidación. En la investigación preclínica se estudian las modificaciones de los extremos para determinar su influencia en la estabilidad metabólica, la unión a los receptores y los parámetros farmacocinéticos. El bloqueo de ambos extremos protege contra la degradación por exopeptidasas.
N
1 términosN-terminus / C-terminus
Los dos extremos de una cadena peptídica lineal. El extremo amino (N-terminus) presenta un grupo amino libre y corresponde al primer residuo de la secuencia. El extremo carboxilo (C-terminus) presenta un grupo carboxilo libre y corresponde al último residuo. Por convención, las secuencias peptídicas se escriben de «N-terminus» a «C-terminus». Ambos extremos son sitios habituales para estrategias de modificación química, entre las que se incluyen la acetilación, la amidación, la «PEGylation» y la lipidación, cuya influencia en la estabilidad de los compuestos y en la actividad biológica se está investigando.
P
4 términosPeso molecular
La suma de los pesos atómicos de todos los átomos de una molécula, expresada en gramos por mol (g/mol) o en daltones (Da). El peso molecular es una propiedad física fundamental que se utiliza para caracterizar los compuestos de investigación peptídicos y se determina analíticamente mediante espectrometría de masas. Se emplea en cálculos de concentración, análisis estequiométricos y como parámetro de referencia en la identificación de compuestos.
PEGylation
La unión covalente de cadenas de polímero de polietilenglicol (PEG) a un péptido o una proteína. PEGylation es una estrategia de modificación estructural que se está investigando en estudios preclínicos por su influencia en parámetros farmacocinéticos, entre los que se incluyen la estabilidad enzimática, la vida media circulante y la inmunogenicidad. El grupo PEG aumenta el radio hidrodinámico y protege al péptido de la degradación proteolítica. PEG La longitud de la cadena y el sitio de unión son variables clave en la investigación sobre PEGylation. Un ejemplo es PEG -MGF, la forma PEGylated del factor de crecimiento mecánico.
Péptido
Una cadena corta de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos, que suele comprender entre 2 y 50 residuos. Los péptidos se distinguen de las proteínas principalmente por la longitud de la cadena, aunque la distinción no está definida de forma rígida. En el ámbito de la investigación, los péptidos sintéticos se producen mediante síntesis de péptidos en fase sólida y se utilizan como herramientas para investigar la farmacología de los receptores, las vías de transducción de señales y las relaciones estructura-actividad. Los péptidos pueden ser lineales o cíclicos y pueden incorporar aminoácidos no estándar y modificaciones químicas.
Pureza
La proporción de una muestra compuesta que corresponde a la molécula objetivo prevista, expresada en porcentaje. La pureza se determina mediante métodos analíticos como lHPLCa y la espectrometría de masas, y se indica en el certificado de análisis (Certificate of Analysis). Los compuestos peptídicos de grado de investigación suelen suministrarse con una pureza del 98 % o superior. Las impurezas pueden incluir secuencias truncadas, secuencias con deleciones, variantes oxidadas y disolventes residuales del proceso de síntesis.
R
3 términosReceptor de melanocortina
Una familia de cinco receptores acoplados a proteínas G (MC1R a MC5R) que se unen a los péptidos de melanocortina derivados de la proopiomelanocortina (POMC). Cada subtipo de receptor presenta una distribución tisular y un perfil de señalización distintos. MC1R se expresa en los melanocitos, MC2R es el receptor de ACTH en las células de la corteza suprarrenal, MC3R y MC4R se expresan en el sistema nervioso central, y MC5R se encuentra en las glándulas exocrinas. Los receptores de melanocortina transmiten su señal principalmente a través de la activación de la adenilato ciclasa acoplada a la proteina Gs. Se utilizan agonistas y antagonistas sintéticos de la melanocortina para investigar la farmacología de los receptores específica de cada subtipo.
Receptor
Proteína que, por lo general, se encuentra en la superficie celular o en el interior de la célula, se une a un ligando específico e inicia una respuesta biológica mediante la transducción de señales. Los receptores se clasifican, según su estructura y mecanismo de señalización, en familias que incluyen los receptores acoplados a proteínas G (GPCR), las tirosina quinasas receptoras (RTK), los canales iónicos activados por ligandos y los receptores nucleares. En la investigación sobre péptidos, la farmacología de los receptores se estudia mediante ensayos de unión, ensayos de señalización funcional y estudios de la relación estructura-actividad.
Reconstitución
El proceso de disolución de un compuesto peptídico liofilizado (secado al vacío) en un disolvente adecuado para obtener una solución destinada a su uso en protocolos experimentales. Entre los disolventes de reconstitución más habituales se encuentran el agua bacteriostática, el agua estéril y el ácido acético diluido. La elección del disolvente depende de las características de solubilidad del péptido, su punto isoeléctrico y las condiciones de ensayo previstas. Las soluciones de péptidos reconstituidas deben manipularse de acuerdo con las directrices de estabilidad específicas del compuesto.
S
7 términosSecretagogo de la hormona del crecimiento
Una clase de compuestos sintéticos que actúan sobre el receptor de la hormona de crecimiento (GHS-R1a), también conocido como receptor de la grelina, para activar las cascadas de señalización posteriores asociadas a la liberación de la hormona del crecimiento en modelos de investigación preclínica. El GHS-R1a es un agonista selectivo de los receptores de la hormona de crecimiento (Gq) acoplado a los receptores de la hormona de la grelina (GPCR). Entre los secretagogos se incluyen hexapéptidos sintéticos como el GHRP-2, el GHRP-6, la hexarelina y la ipamorelina, cada uno de los cuales ha sido estudiado por sus características distintivas de unión al receptor y su perfil estructura-actividad.
Selectividad de los receptores
El grado en que un compuesto se une preferentemente a un subtipo de receptor frente a otros dentro de una misma familia de receptores. La selectividad de los receptores es un criterio fundamental en la investigación sobre la relación estructura-actividad y una variable clave en los estudios de farmacología comparativa. La selectividad se cuantifica comparando las afinidades de unión (valores Kd) o las potencias funcionales (valores EC50) entre los distintos subtipos de receptores. Los compuestos altamente selectivos constituyen valiosas herramientas de investigación para atribuir observaciones biológicas a vías específicas mediadas por receptores.
Secuencia
La disposición ordenada de los residuos de aminoácidos en una cadena peptídica, que se escribe, por convención, desde el extremo N-terminal (N-terminus) hasta el extremo C-terminal (C-terminus) utilizando los códigos estándar de tres o una letra para los aminoácidos. La secuencia determina la estructura primaria de un péptido y es el factor determinante fundamental de sus propiedades de unión a receptores, su actividad biológica y sus características fisicoquímicas. La verificación de la secuencia se lleva a cabo analíticamente mediante espectrometría de masas y degradación de Edman.
SKU
Unidad de gestión de existencias (SKU). Identificador alfanumérico único asignado a cada variante de producto en un sistema de inventario. En el contexto de los compuestos para la investigación de péptidos, las SKU distinguen entre los diferentes compuestos, tamaños de vial, cantidades y formulaciones dentro de un catálogo de productos. Las SKU se utilizan para la gestión de inventario, el seguimiento de pedidos y la identificación de productos.
Solid-Phase Peptide Synthesis
Método de síntesis química en el que se ensambla una cadena peptídica paso a paso sobre un soporte de resina insoluble, un aminoácido cada vez, desde el extremo N-terminal (C-terminus) hasta el extremo C-terminal (N-terminus). El método de Merrifield (SPPS), desarrollado por primera vez por Robert Bruce Merrifield en 1963, es el método de fabricación estándar para los péptidos sintéticos de investigación. Cada ciclo de acoplamiento implica pasos de desprotección, activación y acoplamiento, seguidos de la escisión de la resina y la purificación mediante cromatografía de barrido en fase inversa (HPLC). El método Merrifield (SPPS) permite la incorporación de aminoácidos no estándar, aminoácidos D y modificaciones químicas en posiciones definidas.
Structure-Activity Relationship (SAR)
La relación entre la estructura química de un compuesto y su actividad biológica observada en un receptor diana o dentro de una vía biológica. Los estudios de SAR investigan de forma sistemática cómo las modificaciones en la secuencia de aminoácidos, la química de los extremos, la estereoquímica, la ciclación o la conjugación influyen en la afinidad de unión al receptor, la selectividad y la señalización posterior. La investigación en SAR es fundamental para el diseño de análogos peptídicos y se lleva a cabo mediante la síntesis iterativa y las pruebas farmacológicas de variantes estructurales.
Subcutánea (SC)
Vía de administración de compuestos en la capa de tejido situada entre la piel y el músculo subyacente, estudiada como variable de investigación farmacocinética en modelos preclínicos in vivo. Se investiga la administración subcutánea para determinar su influencia en la cinética de absorción, la formación de depósitos y la biodisponibilidad. El espacio subcutáneo constituye un lugar de depósito desde el cual los compuestos se absorben en la circulación sistémica a velocidades que dependen del peso molecular, la formulación y la perfusión tisular local. La farmacocinética SC se caracteriza en roedores y otros modelos de investigación preclínica.
T
2 términosTransducción de señales
Proceso mediante el cual una interacción entre un receptor y un ligando en la superficie celular desencadena una cascada de eventos bioquímicos intracelulares que dan lugar a una respuesta celular. Las vías de transducción de señales se estudian exhaustivamente en la investigación sobre farmacología de péptidos in vitro mediante técnicas como el Western blotting, los ensayos con genes reporteros, la obtención de imágenes de calcio y la fosfoproteómica. Entre las vías más comunes investigadas en la investigación sobre péptidos se incluyen las cascadas Gs - cAMP - PKA, Gq - PLC - IP3 -calcio, PI3K -Akt-mTOR y MAPK - ERK.
Taquifilaxia
Disminución rápida de la respuesta biológica a un compuesto tras una exposición repetida o continua. En la investigación preclínica con péptidos, la taquifilaxia se estudia como un fenómeno farmacológico relacionado con la desensibilización de los receptores, la internalización o la atenuación de las vías de señalización posteriores. La taquifilaxia es una variable importante en el diseño de los estudios preclínicos, especialmente en la investigación con secretagogos, en la que se analizan protocolos de dosificación intermitente para caracterizar la relación entre los patrones de ocupación de los receptores y la respuesta de señalización sostenida.
U
1 términosUPLC
La cromatografía líquida de ultra alto rendimiento (ULC), también conocida como cromatografía de alta resolución (MS-UPLC) cuando se combina con detección por espectrometría de masas. Se trata de una forma avanzada de cromatografía líquida que funciona a presiones más elevadas y utiliza columnas con un tamaño de partícula más pequeño que la cromatografía de alta resolución convencional (HPLC), lo que proporciona una separación más rápida, una mayor resolución y una sensibilidad incrementada. La cromatografía de alta resolución (UPLC) y la cromatografía de ultra alto rendimiento (MS-UPLC) se utilizan en la investigación de péptidos para el análisis de pureza de alta resolución, la identificación de impurezas y la verificación de compuestos. Los datos de la cromatografía de ultra alto rendimiento (UPLC) complementan el análisis de alta resolución (HPLC) en los certificados de análisis.
V
2 términosVida media
El tiempo que tarda la concentración de un compuesto en un compartimento biológico definido en reducirse hasta el 50 % de su valor inicial. La vida media es un parámetro farmacocinético fundamental que se mide en ein vivoes modelos de investigación preclínica y que se ve influido por la degradación enzimática, el aclaramiento renal, la unión a proteínas y el volumen de distribución. La vida media de los péptidos es un factor determinante en la investigación sobre modificaciones estructurales, ya que la mayoría de los péptidos lineales no modificados presentan vidas medias circulantes cortas debido a una rápida proteólisis.
Vial
Un pequeño envase hermético utilizado para el almacenamiento y la dispensación de compuestos peptídicos liofilizados destinados a la investigación. Los viales de péptidos para investigación suelen estar fabricados en vidrio de borosilicato y se sellan al vacío para evitar la entrada de humedad y contaminantes atmosféricos. Los viales se almacenan en sistemas de almacenamiento en frío con temperatura controlada y supervisada para preservar la integridad de los compuestos. Cada vial está asociado a un número de lote específico y a su correspondiente certificado de análisis (Certificate of Analysis).
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